Hola,
El mecanismo de actualización de renta debe estar especificado en su contrato de alquiler.
Caso de no estarlo, cada mes de Junio deberían hacerse cálculos con el último IPC conocido (el día 1 de Junio tenemos disponible el IPC de Abril), por lo que correspondería aplicar el IPC abri-2008 a abril-2009 (-0,2% según
http://www.ine.es), con lo que su nueva renta se rebajaría 0,89€.
Está en su derecho de que le cobren la nueva renta desde Junio, pero dado lo escaso de la variación creo que los trámites serían más costosos que el ahorro obtenido.
Espero haberle ayudado