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debo pagar por regitrar un contrato de alquiler en hacienda
El contrato no se registra en Hacienda, se declaran los ingresos por parte del propietario en la declaración anual del IRPF.
Sí que tendrá que llevarlo a la oficina de la Comunidad Autónoma encargada de las fianzas, y allí deberá ingresar el importe de la fianza (una mensualidad de renta que deberá haber entregado el arrendatario al propietario) y se lo sellarán.