Hola,
Debe avisarle 30 dias antes del próximo cumpleaños del contrato, que sube la renta y finaliza el contrato, y si acepta, tiene la opción de hacer un anexo o un contrato nuevo, recuerde que si hace un contrato nuevo este tendrá validez por 3 años, un anexo será anual.
Si en el contrato de arrendamiento especificaba la subido del ipc, puede actualizarsela de las 3 años a la vez si no lo ha hecho año por año, y esto lo puede hacer ya mismo, y tendrá efectividad desde el primer pago despues de la notificación al arrendatario, puede comprobar si le interesa aplicar la subida en este enlace
http://www.ine.es/calcula/