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No se si son compatibles.
Tengo entendido que la ayuda por alquiler se dá a determinadas personas para que tengan una vivienda, si tú ya tienes una en propiedad y otra que es de tu padre pero también la quieres alquilar y beneficiarte de ella tú ( tal como nos has dicho en otra consulta), me parece que estás tirando demasiado de la cuerda.
Si la ayuda por alquiler ea compatible con la propiedad de una casa para reformar.