El tratamiento fiscal de un arrendamiento con opción de compra no es fácil de resumir aquí. Solamente puedo decirle que para que haya hecho imponible de IVA es preciso ser sujeto pasivo de ese Impuesto, que no parece ser el caso.
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pedrohernandezabogado.blogspot.com estoy a su disposición por si le puedo ayudar profesionalmente.