Las deducciones por arrendamiento de vivienda habitual dependen de lo previsto en cada Comunidad autónoma, a parte de la deduccíon general, en mis post
http://pedrohernandezabogado.blogspot.com/2009/03/renta-2008-deduccion-por-alquiler.html y
http://pedrohernandezabogado.blogspot.com/2008/11/la-deduccion-fiscal-inquilinos-no.html se exponen los distintos supuestos.
La comisión del Agente no tiene por qué aparecer en el contrato, si bien deberá dar recibo o factura de la misma.
En mi blog, cuya lectura le recomiendo,
pedrohernandezabogado.blogspot.com estoy a su disposición por si le puedo ayudar profesionalmente.